Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl9P51410 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl9P51410 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl9P51410 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms