Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf19aP50636 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19aP50636 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19aP50636 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms