Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms