Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SftpbP50405 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SftpbP50405 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpbP50405 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms