Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cav1P49817 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cav1P49817 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cav1P49817 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cav1P49817 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cav1P49817 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cav1P49817 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cav1P49817 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cav1P49817 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cav1P49817 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cav1P49817 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cav1P49817 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cav1P49817 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cav1P49817 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cav1P49817 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cav1P49817 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cav1P49817 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cav1P49817 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cav1P49817 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cav1P49817 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cav1P49817 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cav1P49817 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cav1P49817 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cav1P49817 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cav1P49817 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cav1P49817 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cav1P49817 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cav1P49817 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cav1P49817 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cav1P49817 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cav1P49817 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cav1P49817 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cav1P49817 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cav1P49817 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cav1P49817 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cav1P49817 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cav1P49817 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cav1P49817 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cav1P49817 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cav1P49817 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cav1P49817 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cav1P49817 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cav1P49817 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cav1P49817 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cav1P49817 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms