Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtpreP49446 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtpreP49446 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpreP49446 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpreP49446 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpreP49446 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtpreP49446 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpreP49446 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtpreP49446 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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