Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl11P48298 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl11P48298 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl11P48298 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms