Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl13P47963 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl13P47963 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl13P47963 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms