Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PfkmP47857 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PfkmP47857 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PfkmP47857 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfkmP47857 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PfkmP47857 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfkmP47857 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms