Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax9P47242 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax9P47242 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax9P47242 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax9P47242 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax9P47242 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax9P47242 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax9P47242 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax9P47242 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms