Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stt3aP46978 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stt3aP46978 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stt3aP46978 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stt3aP46978 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stt3aP46978 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stt3aP46978 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stt3aP46978 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stt3aP46978 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stt3aP46978 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms