Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf5P43027 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf5P43027 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf5P43027 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf5P43027 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf5P43027 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf5P43027 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf5P43027 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf5P43027 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gdf5P43027 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf5P43027 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf5P43027 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf5P43027 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf5P43027 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf5P43027 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf5P43027 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf5P43027 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf5P43027 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf5P43027 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf5P43027 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf5P43027 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf5P43027 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf5P43027 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf5P43027 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf5P43027 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf5P43027 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gdf5P43027 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf5P43027 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gdf5P43027 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf5P43027 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf5P43027 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf5P43027 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gdf5P43027 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf5P43027 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf5P43027 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf5P43027 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms