Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbx1P41778 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbx1P41778 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx1P41778 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms