Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp3P39876 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp3P39876 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timp3P39876 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timp3P39876 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms