Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn1P35821 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpn1P35821 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn1P35821 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms