Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly6fP35460 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6fP35460 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6fP35460 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms