Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab23P35288 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab23P35288 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab23P35288 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab23P35288 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab23P35288 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab23P35288 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab23P35288 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab23P35288 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab23P35288 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab23P35288 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab23P35288 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab23P35288 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab23P35288 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms