Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Stfa1P35175 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Stfa1P35175 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stfa1P35175 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stfa1P35175 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms