Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mmp12P34960 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp12P34960 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp12P34960 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms