Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoc1P34928 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apoc1P34928 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc1P34928 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.5 ms