Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptk2P34152 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ptk2P34152 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptk2P34152 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms