Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apoc3P33622 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoc3P33622 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms