Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa4P31532 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms