Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx2P30658 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cbx2P30658 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx2P30658 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx2P30658 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms