Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atxn10P28658 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atxn10P28658 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn10P28658 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms