Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb1P28230 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gjb1P28230 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb1P28230 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms