Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjc1P28229 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjc1P28229 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjc1P28229 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms