Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vav1P27870 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vav1P27870 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vav1P27870 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vav1P27870 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vav1P27870 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vav1P27870 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vav1P27870 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav1P27870 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms