Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CenpbP27790 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CenpbP27790 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CenpbP27790 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CenpbP27790 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CenpbP27790 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CenpbP27790 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CenpbP27790 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CenpbP27790 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CenpbP27790 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CenpbP27790 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CenpbP27790 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CenpbP27790 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CenpbP27790 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms