Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Twist1P26687 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Twist1P26687 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Twist1P26687 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms