Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NdnP25233 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NdnP25233 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NdnP25233 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NdnP25233 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NdnP25233 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NdnP25233 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NdnP25233 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NdnP25233 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NdnP25233 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NdnP25233 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NdnP25233 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NdnP25233 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NdnP25233 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NdnP25233 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NdnP25233 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NdnP25233 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NdnP25233 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NdnP25233 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NdnP25233 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NdnP25233 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NdnP25233 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NdnP25233 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NdnP25233 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NdnP25233 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NdnP25233 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NdnP25233 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NdnP25233 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NdnP25233 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NdnP25233 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NdnP25233 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NdnP25233 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NdnP25233 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NdnP25233 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NdnP25233 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NdnP25233 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NdnP25233 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NdnP25233 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NdnP25233 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NdnP25233 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NdnP25233 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NdnP25233 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NdnP25233 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NdnP25233 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NdnP25233 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NdnP25233 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NdnP25233 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NdnP25233 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NdnP25233 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NdnP25233 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NdnP25233 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NdnP25233 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms