Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd11P23813 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxd11P23813 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxd11P23813 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd11P23813 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
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