Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkchP23298 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkchP23298 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkchP23298 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkchP23298 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkchP23298 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkchP23298 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkchP23298 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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