Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja1P23242 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja1P23242 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja1P23242 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gja1P23242 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gja1P23242 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja1P23242 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja1P23242 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja1P23242 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja1P23242 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gja1P23242 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gja1P23242 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms