Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gadd45bP22339 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gadd45bP22339 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms