Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tap1P21958 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tap1P21958 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tap1P21958 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tap1P21958 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tap1P21958 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tap1P21958 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tap1P21958 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tap1P21958 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tap1P21958 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tap1P21958 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tap1P21958 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tap1P21958 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tap1P21958 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tap1P21958 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tap1P21958 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tap1P21958 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tap1P21958 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tap1P21958 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tap1P21958 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tap1P21958 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tap1P21958 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tap1P21958 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tap1P21958 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tap1P21958 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tap1P21958 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms