Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou3f1P21952 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pou3f1P21952 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou3f1P21952 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms