Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb4P21440 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb4P21440 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb4P21440 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms