Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Svs4P18419 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svs4P18419 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svs4P18419 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Svs4P18419 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svs4P18419 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svs4P18419 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Svs4P18419 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms