Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata1P17679 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata1P17679 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata1P17679 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata1P17679 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata1P17679 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata1P17679 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata1P17679 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata1P17679 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata1P17679 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata1P17679 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata1P17679 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata1P17679 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gata1P17679 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gata1P17679 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata1P17679 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata1P17679 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata1P17679 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata1P17679 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata1P17679 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata1P17679 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gata1P17679 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gata1P17679 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata1P17679 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gata1P17679 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata1P17679 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata1P17679 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata1P17679 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata1P17679 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata1P17679 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata1P17679 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata1P17679 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata1P17679 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata1P17679 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata1P17679 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata1P17679 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms