Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Itga5P11688 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga5P11688 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga5P11688 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga5P11688 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga5P11688 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga5P11688 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga5P11688 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms