Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spp1P10923 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Spp1P10923 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spp1P10923 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spp1P10923 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spp1P10923 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spp1P10923 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spp1P10923 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spp1P10923 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spp1P10923 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spp1P10923 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spp1P10923 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spp1P10923 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms