Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P10404 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P10404 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P10404 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P10404 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P10404 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P10404 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P10404 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P10404 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P10404 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P10404 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P10404 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P10404 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P10404 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P10404 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P10404 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P10404 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P10404 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P10404 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P10404 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P10404 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P10404 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P10404 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P10404 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P10404 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
P10404 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P10404 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
P10404 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P10404 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P10404 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P10404 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P10404 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P10404 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P10404 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P10404 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P10404 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P10404 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P10404 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P10404 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms