Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb4P10284 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxb4P10284 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb4P10284 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms