Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CatspereP0DP43 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CatspereP0DP43 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CatspereP0DP43 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CatspereP0DP43 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms