Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Igsf6P0C6B7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Igsf6P0C6B7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms