Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd3P09027 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms