Protein–RNA interactions for Protein: P07147

Tyrp1, 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyrp1P07147 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tyrp1P07147 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tyrp1P07147 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tyrp1P07147 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tyrp1P07147 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tyrp1P07147 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms