Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd3dP04235 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd3dP04235 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms