Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04214 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04214 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04214 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04214 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04214 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P04214 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04214 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04214 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04214 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04214 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04214 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04214 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
P04214 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04214 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P04214 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P04214 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P04214 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P04214 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
P04214 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04214 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04214 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04214 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04214 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P04214 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04214 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04214 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04214 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04214 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P04214 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P04214 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P04214 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P04214 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P04214 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P04214 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P04214 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P04214 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P04214 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P04214 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P04214 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P04214 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04214 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04214 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04214 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
P04214 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P04214 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04214 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04214 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04214 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04214 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04214 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04214 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04214 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04214 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P04214 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P04214 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04214 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04214 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04214 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04214 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P04214 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04214 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P04214 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04214 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04214 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04214 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04214 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P04214 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P04214 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P04214 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P04214 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P04214 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P04214 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P04214 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P04214 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P04214 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P04214 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P04214 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P04214 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 301.5 ms