Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01878 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01878 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01878 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01878 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01878 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01878 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01878 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01878 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01878 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01878 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01878 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
P01878 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01878 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P01878 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01878 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01878 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01878 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01878 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01878 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01878 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01878 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
P01878 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01878 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01878 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01878 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01878 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01878 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01878 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P01878 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01878 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01878 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01878 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01878 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01878 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22■■□□□ 1.11
P01878 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01878 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01878 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01878 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
P01878 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01878 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01878 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01878 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01878 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01878 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01878 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01878 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01878 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01878 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01878 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01878 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01878 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01878 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01878 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01878 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01878 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01878 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01878 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P01878 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01878 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01878 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01878 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01878 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01878 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01878 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01878 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01878 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01878 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01878 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01878 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01878 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
P01878 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01878 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01878 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01878 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01878 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01878 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01878 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01878 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01878 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01878 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01878 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01878 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01878 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01878 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01878 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01878 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01878 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01878 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01878 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01878 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms